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从人体微生物组计划（2007年）到国家微生物组计划（2016年），美国酝酿了十年，各国也对微生物组研究投入了大量努力。微生物组学研究发展非常快，肠道微生物组与人体的多种疾病相关联，深刻影响了疾病的治疗和临床研究，包括体重、糖尿病、免疫系统、肠道疾病、代谢疾病、炎症、心脏病、大脑神经系统等等，被认为是人体的“第二基因库”。
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